4月13日晚，神州优车发布《关于收到全国中小企业股转系统第二次第二次问询函的公告》。
公告称，股转系统请神州优车说明上述回复中“神州优车4亿借款”的具体内容;与公司在后续回复中提及的向长盛亿鑫提供4亿元短期借款是否为同一笔借款，如是，请说明将借款4个月利息900万元纳入长盛兴业资金成本的原因;北京宝沃67%股权资产的评估增值与长盛兴业的资金成本数额一致，是否存在依据长盛兴业资金成本确定评估增值数额的情形，如是，请说明其合理性，如否，请说明评估增值的具体依据。
此前的4月3日，神州系在新三板的挂牌主体神州优车曾收到监管部门问询函，要求公司说明瑞幸咖啡事件对公司产生的影响、是否参与对瑞幸咖啡的投资及北京宝沃股权收购相关细节等问题。
随后在4月10日神州优车完成了对全国股转系统的回复，但显然监管层认为一些信息并没有回答的很充分，近日神州优车也第二次收到全国中小企业股份转让系统的问询函，要求其说明陆正耀与王百因是否存在关联关系等5大问题。
全国股转系统第二次问询的核心问题仍大量聚焦在神州优车和宝沃的关系中，针对第一次回复中神州优车4亿元借款及北京宝沃资产增值情况;王百因与陆正耀是否存在同学关系等。
神州优车在第一次回复中称，北京宝沃两次评估结果分别为59.29亿元及61.33亿元，考虑到长盛兴业为收购北京宝沃股权需承担一定资金成本及交易费用，主要包括：70%尾款对应27.81亿元按一年后应向北汽福田支付的利息约1.28亿元，神州优车4亿借款对应约4个月利息900万元，北交所摘牌手续费200万元，公司最终同意向长盛兴业收购北京宝沃67%股权的交易对价41.09亿元。
另外神州优车在第一次回复中称，根据国家企业信用信息系统公示信息等，以及公司自查、公司及控股股东、实际控制人、董事、监事和高管与长盛兴业及其控股股东、实际控制人、董事、监事和高管不存在关联关系。近期媒体报道，“王百因与陆正耀关系密切，两人是北大国发院研究生的同学”。
但全国股转系统此次进一步让神州优车说明，王百因与陆正耀是否存在同学关系或其他交往关系及王百因是否属于《全国中小企业股份转让系统挂牌公司信息披露规则》第七十一条第(九)项所述的“根据实质重于形式原则认定的其他与挂牌公司有特殊关系，可能或者已经造成挂牌公司对其利益倾斜的关联方”。
对于全国股转系统持续的刨根问底，北京地区一家大型事务所律师对记者表示：“全国股转系统的问询集中在和宝沃有关的交易中，其核心是厘清神州优车盘根错节的资本运作关系，进一步揭示公司可能存在的潜在风险。如果充分证明了市场和监管的质疑不存在，一定程度上也降低了公司潜在的风险。”
在股价暴跌停牌的同事，曾经看好神州优车的做市商也开始了撤退的步伐，4月13日，神州优车股份有限公司发布公告称，自4月14日起，中信证券退出为公司股票提供做市报价服务。
除了被问询外，受瑞幸咖啡造假事件的影响，神州租车多次传言“被收购”。而对于这一消息，神州优车13日发布公告，对拟转让神州租车股份的报道进行澄清，称公司正在与潜在投资者接洽，但相关事项尚处于初步商谈阶段，尚未确定任何对手方且并未协商具体条款，该事项仍存在较大不确定性。
公告中还表示，公司实际控制人陆正耀及其一致行动人合计持有公司股票占公司全部发行股份的39.94%，暂未收到陆正耀存在涉诉情况的通知，瑞幸咖啡事件对公司经营活动无直接影响，各项业务正常开展。并提及，“事件发生以来，公司积极与合作金融机构进行沟通，尽量消除负面影响，维护正常资金合作，总体上对公司的现金流影响不大。”
